Την πλήρη άρση της εγγύησης ύψους ενός εκατομμυρίου ευρώ που είχε επιβληθεί στον πρώην υπουργό και νυν βουλευτή του ΠΑΣΟΚ Μιχάλη Καρχιμάκη αποφάσισε με διάταξη που εξέδωσε ο 3ος τακτικός ανακριτής Δημήτρης Φούκας υποστηρίζοντας ότι ο κατηγορούμενος δεν δύναται να την καταβάλει για οικογενειακούς και οικονομικούς λόγους".
Συγκεκριμένα το σκεπτικό της διάταξης αναφέρει: «ενόψει της οικογενειακής και οικονομικής του κατάστασης όπως προκύπτει από τα προσκομισθέντα έγγραφα κρίνεται ότι δεν είναι δυνατή η τήρηση του περιοριστικού όρου της εγγυοδοσίας ενός εκατ. ευρώ που του επιβλήθηκε με την ανωτέρω διάταξή μας. Δεδομένου δε ότι ο κατηγορούμενος διατηρεί σταθερούς δεσμούς με την Ελλάδα, έθεσε εαυτόν στη διάθεση της ανάκρισης και δεν έχει υπάρχει στο παρελθόν φυγόποινος ή φυγόδικος κρίνεται ότι η άρση του όρου δεν θα δυσχεράνει την ανάκριση. Συνεπώς συντρέχει λόγος να αρθεί η εγγυοδοσία του ενός εκατ. ευρώ».
Ο κ. Καρχιμάκης κατηγορείται για ηθική αυτουργία σε παραβίαση μυστικών της πολιτείας.
Σε βάρος του ασκήθηκε δίωξη μετά από αναφορά με ημερομηνία 11.04.2013 υπαλλήλου της ΕΥΠ προς τον διοικητή της υπηρεσίας, σύμφωνα με την οποία ο πρώην υπουργός φέρεται να λάμβανε από υπαλλήλους της ΕΥΠ αντίγραφα των απόρρητων συντασσόμενων κάθε μήνα "αναφορών κατάστασης ασφαλείας - εκτίμησης απειλής", των ημερήσιων δελτίων ενημέρωσης και λοιπών εγγράφων που απευθύνονταν προς τον πρωθυπουργό και τους υπουργούς Εξωτερικών, Δημόσιας Τάξης και Άμυνας. Επίσης φέρεται ότι έπεισε άγνωστο υπάλληλο του ΥΠΕΘΑ να του παραδώσει αντίγραφα εγγράφων με πληροφορίες και ειδήσεις που αφορούσαν στην ασφάλεια και την αμυντική ικανότητα της χώρας που έπρεπε να παραμείνουν απόρρητα.